原告申请网上开庭，被告不同意时，应遵循法院安排现场开庭。《民事诉讼法》规定，开庭方式需双方协商，协商不成由法院决定，不配合可能导致庭审延期。
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被告不同意网上开庭，处理如下：1. 与被告沟通，了解其不愿意的原因，尝试达成共识。2. 若沟通无果，向法院提交申请，说明被告不同意的情况及理由。3. 法院将根据实际情况，决定是否现场开庭，并通知双方开庭时间、地点。
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处理原告申请网上开庭被告不愿意的情况，常见方式有协商、申请法院决定。建议先尝试与被告协商，协商无果则向法院提出申请，由法院根据实际情况决定开庭方式。